Имеется электронная цифровая подпись на носителе USB, всяческих картах, дискетах(ключ).
Не ЭЦП, а сертификат ключа подписи, т.е. открытый ключ, подписанный ЭЦП центра сертификации + еще секретный ключ.
Электронная цифровая подпись (ЭЦП) - это хеш сообщения, зашифрованный на секретном ключе подписанта.
На компьютере ставится какой-то драйвер, который вшивается в систему и Lotus Notes.
Не драйвер, а криптопровайдер (Cryptographic Service Provider, CSP) - динамическая библиотека, предоставляющая приложениям услуги по шифрованию, простановке ЭЦП, хранению и экспортированию ключей шифрования, генерации случайных чисел и проч.
Те CSP, на которые Вы дали ссылки, используют для простановки ЭЦП дополнительные алгоритмы. Например, ГОСТ Р 34.10-2001.
О том, совместим ли без дополнительного ПО такой криптопровайдер с Lotus Notes & Domino - поинтересуйтесь у фирмы-разработчика. Но мне кажется, что такое маловероятно. Скорее всего, Вам придется делать выбор между использованием дополнительного ПО и использованием стандартных средств электронной почты (Outlook Express). А в Лотус Вы даже сертификат импортировать не сможете.
Кстати, вот Вам совет: попросите прислать Вам тестовую версию CSP и ПО центра сертификации. И в теме разберетесь, и заодно проверите, будет оно у Вас работать так, как надо, или нет.
Что касается самообразования, начните с Вики:
Ссылка скрыта от гостей
Ссылка скрыта от гостей
Ссылка скрыта от гостей
Ссылка скрыта от гостей
Там, конечно, бывают ошибки и неточности, но основные понятия раскрываются неплохо.
Потом можно почитать какую-нибудь книгу по ЗИ.
Например, Хорев П.Б. "Методы и средства защиты информации в компьютерных системах".
И последнее - я так понял, Вы организуете юридически значимый электронный документооборот? Если нет, то все эти дополнительные CSP Вам нах не нужны. Можно спокойно обходиться средствами Lotus. Кстати, сервер Domino может работать и как полноценный Certification Authority.