Теоретически в разных базах могут быть документы с одинаковым unid, т.е. нет однозначного соответствия.
Можно попробовать перебирать базы (NotesDbDirectory) и открывать документы с данным unid с обработкой ошибки отсутствия, но если документ был удалён, определить, в какой базе он "жил", кмк, невозможно.
