Что подразумевается под архивацией? Скидывать ее всю в какую-либо базу (или набор баз) и потом сливать архивы баз куда-либо? Или что-то еще?
Если мое предположение верно, то наверное проще всего в базе mail.box сервера на событие прихода почты повесить агента, который просто копировать будет почтовый документ в базу архива. Надо еще в хэлпе по администрированию покопаться, может есть штатные средства для реализации этой логики.