Достаточно знать внутренне имя файла, UNID документа реплику или путь к БД. Внутренне имя файла можно получить через NotesEmbeddedObject.Name или @AttachmentNames.
Для перетягивания файла использовать NotesEmbeddedObject через Java или COM интерфейсы. Либо по URL через HTTP, но на сервере должна быть поднята http-задача.