В чем угодно может быть дело. Этот вопрос из той же серии: у меня не работает Лотус, почему? Слишком пространно и неконкретно задан вопрос, как долго начинает грузиться, что происходит при этом, в какой конкретный момент все ок становится и т.д.. А вообще, слишком много может быть причин возникновения проблемы.
Проблема может быть начиная с операционной системы и того же антивируса и заканчивая проблемой с коннектом с каким-либо из серверов и вовсе - настройками лотуса. Даже неправильно настроенный сетевой принтер или какие-либо сетевые ресурсы, используемые в работе, могут быть причиной тормозов.
В общем, надо смотреть на месте, в чем причина. Для начала можно глянуть в строке статуса/состояния клиента Lotus Notes (кликнуть на неё, развернется небольшой лог из сообщений статуса клиента LN), что он там пишет, может вываливаются какие-то конкретные ошибки