Так в любом случае суть такова - берешь в исходной базе отчет, дающий нужные результаты
и добавляешь к нему вывод в файл-переходник необходимых данных.
Далее, на основании этого файла в 4.5 формируешь операцию, каждая проводка которой
создается из строки переходного файла.
Вариант загрузки данных по зарплате из ЗиК в бухгалтерию могу прислать, а выгрузку уж сам.
Разумеется, должна быть синхронизация по планам счетов и справочнику "Сотрудники" (или еще каким-то)
Если я правильно понял проблему, делов-то там на час-полтора